Les armoiries de l'Yonne se blasonnent : d'azur au pairle d'or, à la bordure de gueules.

Elle ont été présentées lors de la manifestation commémorant le bicentenaire de l'installation du conseil général le 22 mars 1990. Le pairle ou Y est l'initiale du nom du département et également la marque héraldique du pallium que l'archvêque revêtait sur ses habits sacerdotaux. La partition su champ en trois secteurs évoque les trois arrondissements : Auxerrois, Senonais et Avallonais. La bordure est le signe d'une filiation, d'une appartenance. Les couleurs sont celles de la Bourgogne.

Les armoiries sont timbrées d'une couronne murale à trois tours sur lesquelles est fiché un mât avec une banderole chargé des noms "Sens", "Auxerre" et "Avallon". L'écu est entouré de branches de chêne et de laurier, les branchages liées à la pointe de l'écu avec des branches de vignes et un ruban d'azur, chargé d'un listel d'or chargé des mots "DÉPARTEMENT DE L'YONNE" en lettres de sable.

Source textuelle et iconographique : archives de Lucien Philippe ; "Le lettre du président" n° 23, décembre 1990
Redessiné par : Pascal Vagnat

Les armoiries de l'Yonne, proposées par l'héraldiste Robert Louis dans les années 1950, se blasonnaient : coupé, au premier: parti, en I: d'azur semé de fleurs de lys d'or à la bordure componée de gueules et d'argent; en II: bandé de six pièces d'azur et d'or à la bordure de gueules; au deuxième d'or à un pairle d'azur.

Ce sont pour partie les armoiries de la Bourgogne avec un pairle représentant l'initiale du département.