Les armoiries d'Auxonne se blasonnent : parti, au premier: coupé, en I: d'azur semé de fleurs de lys d'or à la bordure componée de gueules et d'argent; en II: bandé de six pièces d'azur et d'or à la bordure de gueules; au deuxième, mi-parti d'azur à la croix ancrée d'argent.
L’origine de ces armoiries est inconnue. Les armes primitives de la ville se blasonneraient : d’azur à la croix ancrée d’argent.
Source iconographique : http://www.auxonne.fr
Source textuelle : http://www.cotedor.fr/files/content/sites/cg21-2/files/conseilgeneral21/pdf-documents-cg21/pdf-doc-institution-cg21/Histoire-du-departement/plaquettepatrimoine.pdf